MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 chromosome

Total Repeats: 52306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011883	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903287
2	NC_011883	GAAC	2	8	466	473	50 %	0 %	25 %	25 %	220903287
3	NC_011883	GGC	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903287
4	NC_011883	TGA	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903287
5	NC_011883	GTA	2	6	554	559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903287
6	NC_011883	CAT	2	6	613	618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903287
7	NC_011883	GCC	2	6	654	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
8	NC_011883	T	6	6	661	666	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
9	NC_011883	T	6	6	678	683	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
10	NC_011883	AG	3	6	751	756	50 %	0 %	50 %	0 %	220903288
11	NC_011883	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	220903288
12	NC_011883	CG	3	6	840	845	0 %	0 %	50 %	50 %	220903288
13	NC_011883	CG	3	6	984	989	0 %	0 %	50 %	50 %	220903288
14	NC_011883	GCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
15	NC_011883	CCA	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903288
16	NC_011883	CAG	2	6	1546	1551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
17	NC_011883	GGC	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903288
18	NC_011883	CGA	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903288
19	NC_011883	A	6	6	1713	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	220903288
20	NC_011883	CGC	2	6	1726	1731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
21	NC_011883	CCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
22	NC_011883	TAC	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903288
23	NC_011883	CCG	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903288
24	NC_011883	GAA	2	6	1913	1918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903288
25	NC_011883	GGA	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220903288
26	NC_011883	CGG	2	6	1947	1952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903288
27	NC_011883	CAA	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903288
28	NC_011883	GAG	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220903288
29	NC_011883	TAT	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220903289
30	NC_011883	A	6	6	2646	2651	100 %	0 %	0 %	0 %	220903289
31	NC_011883	CTGG	2	8	2699	2706	0 %	25 %	50 %	25 %	220903289
32	NC_011883	GGT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903289
33	NC_011883	GCC	2	6	2892	2897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
34	NC_011883	GCCC	2	8	2920	2927	0 %	0 %	25 %	75 %	220903289
35	NC_011883	C	6	6	2925	2930	0 %	0 %	0 %	100 %	220903289
36	NC_011883	GCA	2	6	2944	2949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903289
37	NC_011883	GCC	2	6	3036	3041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
38	NC_011883	GCC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
39	NC_011883	TTC	2	6	3109	3114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903289
40	NC_011883	CCG	2	6	3142	3147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
41	NC_011883	CCCG	2	8	3150	3157	0 %	0 %	25 %	75 %	220903289
42	NC_011883	GCC	2	6	3174	3179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
43	NC_011883	TG	3	6	3200	3205	0 %	50 %	50 %	0 %	220903289
44	NC_011883	GAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903289
45	NC_011883	CAGA	2	8	3329	3336	50 %	0 %	25 %	25 %	220903289
46	NC_011883	GCC	2	6	3399	3404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
47	NC_011883	TGG	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903289
48	NC_011883	GCT	2	6	3584	3589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903289
49	NC_011883	GGTG	2	8	3644	3651	0 %	25 %	75 %	0 %	220903289
50	NC_011883	TAA	2	6	3671	3676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903289
51	NC_011883	A	6	6	3724	3729	100 %	0 %	0 %	0 %	220903289
52	NC_011883	CGG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903289
53	NC_011883	TA	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	220903289
54	NC_011883	GCC	2	6	3853	3858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903289
55	NC_011883	AT	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	220903289
56	NC_011883	TAA	2	6	3935	3940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903289
57	NC_011883	TGAAA	2	10	3995	4004	60 %	20 %	20 %	0 %	220903289
58	NC_011883	TAA	2	6	4176	4181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903290
59	NC_011883	ATC	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903290
60	NC_011883	ATT	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220903290
61	NC_011883	CGG	2	6	4278	4283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
62	NC_011883	CAGGG	2	10	4369	4378	20 %	0 %	60 %	20 %	220903290
63	NC_011883	TGC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903290
64	NC_011883	CTG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903290
65	NC_011883	CGC	2	6	4468	4473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903290
66	NC_011883	GCG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
67	NC_011883	TTC	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903290
68	NC_011883	TGCC	2	8	4626	4633	0 %	25 %	25 %	50 %	220903290
69	NC_011883	ATG	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903290
70	NC_011883	CCA	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903290
71	NC_011883	ACG	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903290
72	NC_011883	GCCT	2	8	4733	4740	0 %	25 %	25 %	50 %	220903290
73	NC_011883	AAG	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903290
74	NC_011883	GCA	2	6	4844	4849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903290
75	NC_011883	AAG	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903290
76	NC_011883	TCC	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220903290
77	NC_011883	TCGGC	2	10	5078	5087	0 %	20 %	40 %	40 %	220903290
78	NC_011883	CGG	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903290
79	NC_011883	AGAC	2	8	5186	5193	50 %	0 %	25 %	25 %	220903290
80	NC_011883	ATG	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903290
81	NC_011883	ATC	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903290
82	NC_011883	CGG	2	6	5339	5344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
83	NC_011883	CTT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903291
84	NC_011883	TA	3	6	5409	5414	50 %	50 %	0 %	0 %	220903291
85	NC_011883	CG	4	8	5426	5433	0 %	0 %	50 %	50 %	220903291
86	NC_011883	GTG	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
87	NC_011883	ACA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
88	NC_011883	CGTG	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	220903291
89	NC_011883	AAGG	2	8	5583	5590	50 %	0 %	50 %	0 %	220903291
90	NC_011883	CCG	2	6	5596	5601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
91	NC_011883	GGT	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
92	NC_011883	CGG	2	6	5630	5635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
93	NC_011883	CGG	2	6	5666	5671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
94	NC_011883	CAC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903291
95	NC_011883	A	6	6	5892	5897	100 %	0 %	0 %	0 %	220903291
96	NC_011883	CAA	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
97	NC_011883	AC	3	6	5967	5972	50 %	0 %	0 %	50 %	220903291
98	NC_011883	GGC	2	6	5988	5993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
99	NC_011883	CGT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903291
100	NC_011883	CAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
101	NC_011883	AAGG	2	8	6153	6160	50 %	0 %	50 %	0 %	220903291
102	NC_011883	CGA	2	6	6269	6274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903291
103	NC_011883	TCA	2	6	6298	6303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903291
104	NC_011883	GCCGCA	2	12	6314	6325	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220903291
105	NC_011883	AGACCA	2	12	6337	6348	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220903291
106	NC_011883	GTG	2	6	6387	6392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
107	NC_011883	GAA	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903291
108	NC_011883	GCCCGC	2	12	6468	6479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
109	NC_011883	GCC	2	6	6483	6488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
110	NC_011883	CGC	2	6	6510	6515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
111	NC_011883	CGGC	2	8	6613	6620	0 %	0 %	50 %	50 %	220903291
112	NC_011883	CAA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903291
113	NC_011883	GAC	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903291
114	NC_011883	ATC	3	9	6810	6818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903291
115	NC_011883	CA	3	6	6844	6849	50 %	0 %	0 %	50 %	220903291
116	NC_011883	CTG	3	9	6858	6866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903291
117	NC_011883	CTT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220903291
118	NC_011883	T	6	6	6873	6878	0 %	100 %	0 %	0 %	220903291
119	NC_011883	TGG	2	6	6895	6900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903291
120	NC_011883	GCC	2	6	6926	6931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903291
121	NC_011883	TCA	2	6	6967	6972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903291
122	NC_011883	CG	3	6	7006	7011	0 %	0 %	50 %	50 %	220903291
123	NC_011883	CAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903291
124	NC_011883	GAT	2	6	7275	7280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903291
125	NC_011883	CCA	2	6	7319	7324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903291
126	NC_011883	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	220903291
127	NC_011883	GGC	2	6	7407	7412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903291
128	NC_011883	AGC	2	6	7549	7554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903291
129	NC_011883	GCCGC	2	10	7664	7673	0 %	0 %	40 %	60 %	220903291
130	NC_011883	CAG	2	6	7982	7987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903292
131	NC_011883	GCA	2	6	7998	8003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903292
132	NC_011883	TCA	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903292
133	NC_011883	CAT	2	6	8121	8126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903292
134	NC_011883	CAA	2	6	8148	8153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220903292
135	NC_011883	CCGC	2	8	8177	8184	0 %	0 %	25 %	75 %	220903292
136	NC_011883	TCG	2	6	8186	8191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903292
137	NC_011883	ATG	2	6	8237	8242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903292
138	NC_011883	TGG	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903292
139	NC_011883	CGG	2	6	8330	8335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903292
140	NC_011883	CTG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903292
141	NC_011883	CCA	2	6	8516	8521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903292
142	NC_011883	GAT	2	6	8575	8580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903292
143	NC_011883	GCA	2	6	8588	8593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903292
144	NC_011883	TGA	2	6	8595	8600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903292
145	NC_011883	CCA	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220903292
146	NC_011883	ACG	2	6	8669	8674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903292
147	NC_011883	TCA	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903292
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149	NC_011883	TCA	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903292
150	NC_011883	CGC	2	6	8948	8953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903292
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155	NC_011883	TGA	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903292
156	NC_011883	GC	4	8	9193	9200	0 %	0 %	50 %	50 %	220903292
157	NC_011883	AGGCCA	2	12	9236	9247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903292
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159	NC_011883	TGC	2	6	9365	9370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903292
160	NC_011883	GCG	2	6	9371	9376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903292
161	NC_011883	CGC	2	6	9419	9424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903292
162	NC_011883	TGC	2	6	9437	9442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903292
163	NC_011883	GACATT	2	12	9457	9468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220903292
164	NC_011883	TGA	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903292
165	NC_011883	TCA	2	6	9497	9502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220903292
166	NC_011883	GTCGC	2	10	9507	9516	0 %	20 %	40 %	40 %	220903292
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168	NC_011883	CGC	2	6	9579	9584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903292
169	NC_011883	ACCA	2	8	9631	9638	50 %	0 %	0 %	50 %	220903292
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178	NC_011883	GACCA	2	10	10102	10111	40 %	0 %	20 %	40 %	220903292
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262	NC_011883	GCC	2	6	14650	14655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903296
263	NC_011883	GCGCCC	2	12	14721	14732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903296
264	NC_011883	GCG	2	6	14889	14894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903296
265	NC_011883	CCTGCG	2	12	14913	14924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220903296
266	NC_011883	CGC	2	6	15080	15085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903296
267	NC_011883	TGG	2	6	15107	15112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220903296
268	NC_011883	GCT	2	6	15143	15148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220903296
269	NC_011883	GC	3	6	15165	15170	0 %	0 %	50 %	50 %	220903296
270	NC_011883	GAA	2	6	15223	15228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903296
271	NC_011883	CGG	2	6	15462	15467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903296
272	NC_011883	GATCAA	2	12	15543	15554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220903296
273	NC_011883	CGA	2	6	15558	15563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903296
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275	NC_011883	CGA	2	6	15594	15599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903296
276	NC_011883	GGCG	2	8	15660	15667	0 %	0 %	75 %	25 %	220903296
277	NC_011883	GAA	2	6	15796	15801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220903296
278	NC_011883	TGA	2	6	15860	15865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220903296
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280	NC_011883	GCG	2	6	15929	15934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903296
281	NC_011883	CCG	2	6	16054	16059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903296
282	NC_011883	CGG	2	6	16062	16067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903296
283	NC_011883	CAG	2	6	16113	16118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220903296
284	NC_011883	GACG	2	8	16170	16177	25 %	0 %	50 %	25 %	220903296
285	NC_011883	GGC	2	6	16191	16196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903296
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288	NC_011883	CT	3	6	16572	16577	0 %	50 %	0 %	50 %	220903297
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293	NC_011883	GCC	2	6	16783	16788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903297
294	NC_011883	GCG	2	6	16790	16795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903297
295	NC_011883	A	7	7	16817	16823	100 %	0 %	0 %	0 %	220903297
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297	NC_011883	GAG	2	6	16888	16893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220903298
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300	NC_011883	CGG	2	6	16950	16955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903298
301	NC_011883	CCG	2	6	16980	16985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220903298
302	NC_011883	A	6	6	16988	16993	100 %	0 %	0 %	0 %	220903298
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381	NC_011883	GCG	3	9	21775	21783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903301
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387	NC_011883	AT	3	6	21982	21987	50 %	50 %	0 %	0 %	220903301
388	NC_011883	GCG	2	6	22029	22034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220903301
389	NC_011883	CCT	2	6	22063	22068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220903301
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391	NC_011883	ATA	2	6	22096	22101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220903301
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